Nel 20esimo secolo la Terra è minacciata da una razza aliena che rapisce e uccide umani e persino animali e li usa per le loro parti del corpo. Nel 1980 S.H.A.D.O. (Supreme Headquarters Alien Defense Organization), un’organizzazione militare altamente segreta, viene istituita nella speranza di difendere la Terra da questa minaccia aliena. Questa organizzazione opera da un luogo segreto sotto lo studio cinematografico Henderson-Straker a Londra. S.H.A.D.O. ha anche una base sulla luna con intercettori e un satellite di allerta precoce che rileva gli UFO in arrivo (chiamati SID) e gestisce una flotta di sottomarini. Il generale James Henderson e il comandante Ed Straker hanno una squadra di femmine e maschi altamente addestrati e ben equipaggiati per combattere gli UFO ostili regolarmente in arrivo.
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